Il gioco ?¿ incentrato sulla storia di Ende e Ceres, un ragazzo e una ragazza che vivono nel Regno di Elysium, nella nazione di Graecia. Gli eventi iniziano con Ceres, una ragazza di 18 anni, che viene scelta per cantare durante l'Harvest Festival del regno, ma proprio durante l'evento dei misteriosi e inquietanti esseri attaccano gli abitanti, colpendo anche Ceres. Quest'ultima da questo momento in poi subisce una maledizione, ed Ende, un ex-soldato di 22 anni, dovr?á imbarcarsi in una grande avventura per salvarla. Si trover?á infatti a recuperare l'Orichalcum Chain, in modo da sconfiggere e raccogliere i resti delle bestie che vivono nelle 13 Torri disseminate per il regno, ed evitare che Ceres stessa si trasformi a lungo andare in una di quelle bestie. Oltre a portare avanti il gioco dal punto di vista dei combattimenti e del completamento delle torri, ?¿ necessario anche coltivare il rapporto tra Ende e Ceres: in base a quanto e come questo si svilupper?á, la storia proseguir?á in maniera diversa fino ad uno dei 6 possibili finali.